EMU
Lista de Equipamentos Multiusuários
NextSeq 550 - Illumina
O que é?
Instrumento bastante versátil que possibilita tanto a análise por sequenciamento de última geração quanto arranjo.
Possíveis aplicações:
Utilizado principalmente na análise de sequência de genomas pequenos, exomas, transcriptomas (RNA total, mRNA, miRNA, lncRNA), regiões metiladas, genotipagens, entre outras aplicações.
Vantagens do sistema:
Sequenciamento de leituras de 1x75 bp (até 30 Gb), 2x75 bp (até 60 Gb) e 2x150 bp (até 120 Gb) com output de 130 a 800 milhões de leituras. Função arranjo utilizando o seguintes kits: Infinium MethylationEPIC BeadChip, Infinium CytoSNP-850 BeadChip, HumanCytoSNP-12 BeadChip e Infinium HumanKaryomap-12 BeadChip.
Mais informações:
https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/nextseq.html
https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/nextseq/specifications.html
https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms.html
Custo por corrida:
-Pesquisadores da UFSCar – R$ 2.500,00
-Demais pesquisadores – R$ 3.000,00
A operação do equipamento será realizada pelo técnico responsável. O usuário deverá fornecer os reagentes necessários para a corrida compatíveis com o equipamento, em embalagem lacrada e dentro do prazo de validade. Em caso de sequenciamento, também deverá fornecer o pool de biblioteca devidamente quantificado e com concentração ajustada de acordo com as recomendações do fabricante. Os resultados serão compartilhados via plataforma BaseSpace, Illumina, em formato FASTQ. Para outras informações bem como o agendamento do equipamento, escrever para lmbcm@ufscar.br.
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